All modules for which code is available

• batter.analysis.analysis
• batter.analysis.cinnabar
• batter.analysis.cycle_closure
• batter.analysis.remd
• batter.analysis.utils
• batter.api
• batter.config
• batter.config.run
• batter.config.simulation
• batter.config.utils
• batter.exec.amber.mdin
• batter.exec.base
• batter.exec.handlers.equil
• batter.exec.handlers.fe
• batter.exec.handlers.fe_analysis
• batter.exec.handlers.param_ligands
• batter.exec.handlers.prepare_equil
• batter.exec.handlers.prepare_fe
• batter.exec.handlers.system_prep
• batter.exec.handlers.system_prep_masfe
• batter.exec.local
• batter.exec.slurm
• batter.exec.slurm_mgr
• batter.orchestrate.backend
• batter.orchestrate.pipeline_utils
• batter.orchestrate.run
• batter.param.ligand
• batter.pipeline.payloads
• batter.pipeline.pipeline
• batter.pipeline.step
• batter.rbfe
• batter.runtime.fe_repo
• batter.runtime.portable
• batter.systems.core
• batter.systems.mabfe
• batter.systems.masfe
• batter.utils.exec_clone